Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMD4AQ9P2Q2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms