Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms