Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms