Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms