Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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