Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHRDL1Q9BU40 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms