Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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