Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms