Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms