Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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