Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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