Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms