Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms