Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms