Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNFT2Q96EX2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNFT2Q96EX2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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