Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms