Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms