Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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