Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CLEC4CQ8WTT0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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