Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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