Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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