Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms