Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDZK1Q5T2W1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDZK1Q5T2W1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDZK1Q5T2W1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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