Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms