Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms