Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RFTN2Q52LD8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms