Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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