Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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