Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms