Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FXNQ16595 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FXNQ16595 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms