Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ATP6AP1Q15904 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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