Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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