Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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GRK1Q15835 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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GRK1Q15835 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GRK1Q15835 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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