Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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