Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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