Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms