Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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