Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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