Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms