Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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