Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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