Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTCH1Q13635 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTCH1Q13635 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTCH1Q13635 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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