Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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