Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms