Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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