Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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