Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms