Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms