Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms