Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms